膠質瘤的DNA甲基化
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成人瀰漫性膠質瘤的DNA甲基化
低級別膠質瘤的分子特點揭示了三種亞型,後者和預後密切相關。
● I型:1p19q共缺失 + IDH1/2突變型
● II型:1p19q無缺失 + IDH1/2突變型
● III型:1p19q無缺失 + IDH1/2野生型且頻繁出現TP53突變
繼發性膠質母細胞瘤演變來自低級別膠質瘤,最常是II 或III型低級別膠質瘤。
1983年發現,和相應的正常組織相比,腫瘤細胞中特定的基因位點上窩藏有低水平的甲基化(亦即低甲基化的)。
1999年首次發現了CpG島甲基化表型(CIMP),其特點是結腸癌的全基因組CpG島是超甲基化的。
今天,CpG島甲基化陽性腫瘤被發現可見於一系列腫瘤類型,且常常形成獨一無二的亞型。
(1) 膠質瘤CpG島甲基化表型(G-CIMP)的出現,和IDH突變以及好的總體預後相關,常見於低級別膠質瘤。
(2) MGMT啓動子甲基化可見於部分膠質瘤病人,此類病人對DNA烷化劑治療有明顯效果。
成人膠質瘤一大部分是膠質瘤CpG島甲基化表型(G-CIMP),特點是全面的超甲基化狀態。然而這種表型被認爲和IDH突變密切相關。最近發現認爲IDH1的表達足以誘導膠質瘤中CpG島甲基化表型(G-CIMP)產生。
作爲結果,幾乎所有的包藏有IDH突變的腫瘤(I和 II型低級別膠質瘤和部分繼發性膠質母細胞瘤)均是膠質瘤CpG島甲基化表型(G-CIMP)陽性。
實際上,膠質瘤CpG島甲基化表型陽性腫瘤被發現頻繁出現於低級別膠質瘤,尤其是少枝膠質細胞瘤,後者在分子學上歸屬於膠質瘤I型。
進一步發現,和CpG島甲基化表型陰性的膠質母細胞瘤相比,CpG島甲基化表型陽性膠質母細胞瘤的基因表達內容更和低級別膠質瘤相似。
同樣的,CpG島甲基化表型陰性的低級別膠質瘤預後較差,被頻繁描述爲 “類膠質母細胞瘤”,因爲它們的遺傳學和分子學和高級別膠質瘤相似。
膠質瘤CpG島甲基化表型(G-CIMP)似乎是膠質瘤起源時候的一個早期的事件,普遍情況下一直持續到進展或和復發。
在膠質瘤CpG島甲基化表型(G-CIMP)陽性腫瘤中,甲基化水平的全面降低和復發以及增高的腫瘤級別相關。發現,和它們相應的原來的腫瘤相比,復發的膠質母細胞瘤中甲基化減低的和過度表達的基因包括幾個涉及細胞週期調節的基因,例如TP73。
使用Ki-67作爲細胞增殖活性的標記,作者在復發病例中發現相當高比例的活性增殖細胞,暗示特定的低甲基化事件可能有助於膠質母細胞瘤中增高的增殖現象。
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